昌吉回族自治州的乌鲁木齐县划归乌鲁木齐市（国务院1959年11月9日批准）
和阗专区更名为和田专区；和阗县更名为和田县（国务院1959年6月16日批准）
婼羌县更名为若羌县（国务院1959年6月16日批准）
于阗县更名为玉田县（国务院1959年6月16日批准）
玉田县更名为于田县（国务院1959年8月3日批准）
设立乌鲁木齐市天山区、沙依巴克区、新市区、水磨沟区、头屯河区（国务院1959年批准）
富蕴县驻地由可可托海迁至额尔齐斯镇
裕民县驻地由察汗托海迁至哈拉哈布